应用领域柠檬酸钠在食品、饮料工业中用作风味剂、稳定剂;在化学上是优良的螯合剂/络合剂,在工业上对柠檬酸钠的应用都是利用此一特性。还用于酿造、摄影电镀等。
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具有生物降解性。柠檬酸钠经自然界大量的水稀释后，部分变成柠檬酸，两者共存于同一体系中。柠檬酸在水中经氧、热、光、以及微生物的作用，很容易发生生物降解。其分解途径一般是经乌头酸、衣康酸、柠康酸酐，转变为二氧化碳和水。
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在医学，柠檬酸钠的用途也很广泛。利用柠檬酸根与钙离子能形成可溶性络合物的特性，可用作剂和输血剂，保存和加工血制品。柠檬酸钠作为防腐剂，用于保存糖浆等。柠檬酸钠注射时和钾盐一样，用于矫正血液、体液及尿液的酸度，作为化痰剂等。柠檬酸钠与别的试剂配伍可用于提取、纯化动物糖核酸。
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